Используйте get_json в примере jstree
var v =$("#jseq_tree").jstree(true).get_json('#', { 'flat': true });
Perfect Platypus
var v =$("#jseq_tree").jstree(true).get_json('#', { 'flat': true });
var v =$("#jseq_tree").jstree(true).get_json('#', { 'flat': true });