Если emacs, который вы запускаете в Linux, создает новое окно, то вы запускаете его как приложение X11 (приложение с графическим интерфейсом). Обычно emacs в Linux и других системах просто запускается в терминале, который вы открыли (как консольное приложение).
Версия emacs, которая поставляется с OS X, скомпилирована только для запуска в терминале. Для репликации запуска в новом окне вам нужна другая версия emacs. я хотел бы использовать Aquamacs это emacs, модифицированный для работы как обычное приложение OSX Cocoa. Стандарт GNU Emacs имеет версию приложения Какао, которая по умолчанию больше похожа на поведение на других платформах и доступна в двоичной версии Вот ,
Вы также можете получить версии X11. Вот исчерпывающий список доступных типов Emacs для OS X ,